MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 70999

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011312	TC	3	6	70044	70049	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1502	NC_011312	TC	3	6	70101	70106	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1503	NC_011312	TAAA	2	8	70121	70128	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_011312	GATT	2	8	70133	70140	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_011312	AAT	2	6	70207	70212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_011312	TGGT	2	8	70256	70263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_011312	A	6	6	70281	70286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_011312	G	6	6	70345	70350	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_011312	ACT	2	6	70390	70395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_011312	ACG	2	6	70411	70416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_011312	ATG	2	6	70517	70522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_011312	AAG	2	6	70598	70603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_011312	CTT	2	6	70622	70627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_011312	TAT	2	6	70638	70643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_011312	A	6	6	70648	70653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_011312	ATG	2	6	70685	70690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_011312	TGA	2	6	70758	70763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_011312	ACG	2	6	70768	70773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_011312	AC	3	6	70823	70828	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1520	NC_011312	CGA	2	6	70840	70845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_011312	AGCA	2	8	70887	70894	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1522	NC_011312	TGT	2	6	70911	70916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_011312	ACA	2	6	70969	70974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_011312	GCA	2	6	70978	70983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_011312	TATT	2	8	71093	71100	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_011312	CGCT	2	8	71368	71375	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1527	NC_011312	CAT	2	6	71406	71411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_011312	TCTG	2	8	71543	71550	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1529	NC_011312	TAA	2	6	71587	71592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_011312	TCG	2	6	71686	71691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_011312	CGTG	2	8	71693	71700	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1532	NC_011312	GTT	2	6	71930	71935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_011312	TCA	2	6	71936	71941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_011312	GTT	2	6	71955	71960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_011312	TTA	2	6	71984	71989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_011312	TTA	2	6	72015	72020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_011312	AAT	2	6	72046	72051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_011312	TAA	2	6	72117	72122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_011312	T	7	7	72209	72215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_011312	GCAT	2	8	72311	72318	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1541	NC_011312	ATA	2	6	72364	72369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_011312	TG	3	6	72436	72441	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_011312	TCA	2	6	72442	72447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_011312	ATG	2	6	72454	72459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_011312	TCT	3	9	72463	72471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_011312	GAGTC	2	10	72494	72503	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1547	NC_011312	AGCC	2	8	72537	72544	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1548	NC_011312	AGA	2	6	72556	72561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_011312	TATT	2	8	72568	72575	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_011312	TTTTA	2	10	72627	72636	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_011312	TA	3	6	72654	72659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_011312	ATA	2	6	72663	72668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_011312	AATC	2	8	72674	72681	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1554	NC_011312	CCT	2	6	72687	72692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1555	NC_011312	GTT	2	6	72723	72728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693694
1556	NC_011312	TGC	2	6	72786	72791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693694
1557	NC_011312	TTAT	2	8	72813	72820	25 %	75 %	0 %	0 %	209693694
1558	NC_011312	CAATA	2	10	72888	72897	60 %	20 %	0 %	20 %	209693694
1559	NC_011312	CAA	2	6	72973	72978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693694
1560	NC_011312	TGG	2	6	73036	73041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209693694
1561	NC_011312	TGAT	2	8	73063	73070	25 %	50 %	25 %	0 %	209693694
1562	NC_011312	TAA	2	6	73078	73083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693695
1563	NC_011312	GAT	2	6	73174	73179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693695
1564	NC_011312	GAA	2	6	73475	73480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_011312	GAT	2	6	73688	73693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_011312	A	6	6	73701	73706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_011312	GTC	2	6	73753	73758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_011312	GGAT	2	8	73784	73791	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_011312	TCA	2	6	73801	73806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_011312	T	6	6	73811	73816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_011312	TGC	2	6	73826	73831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_011312	CCA	2	6	73857	73862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1573	NC_011312	CAT	2	6	73889	73894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_011312	CGT	3	9	73958	73966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_011312	ATG	2	6	73977	73982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_011312	ACCA	2	8	74034	74041	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1577	NC_011312	T	6	6	74126	74131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_011312	CCG	2	6	74163	74168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1579	NC_011312	AAG	2	6	74178	74183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_011312	CCT	2	6	74244	74249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1581	NC_011312	AAAGT	2	10	74323	74332	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_011312	GAG	2	6	74380	74385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_011312	GGA	2	6	74405	74410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_011312	ACC	2	6	74432	74437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1585	NC_011312	TCA	2	6	74538	74543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_011312	TGA	2	6	74623	74628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_011312	AGC	2	6	74642	74647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_011312	CTA	2	6	74749	74754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_011312	CAA	2	6	74815	74820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_011312	AGAA	2	8	74906	74913	75 %	0 %	25 %	0 %	209693696
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1596	NC_011312	TGG	2	6	75051	75056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209693696
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1598	NC_011312	CGA	2	6	75093	75098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693696
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1602	NC_011312	AG	3	6	75161	75166	50 %	0 %	50 %	0 %	209693696
1603	NC_011312	ACG	2	6	75187	75192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693696
1604	NC_011312	TTG	2	6	75223	75228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693696
1605	NC_011312	T	6	6	75304	75309	0 %	100 %	0 %	0 %	209693696
1606	NC_011312	ATA	2	6	75341	75346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693696
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1619	NC_011312	TTC	2	6	75898	75903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693696
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1621	NC_011312	TTCGT	2	10	76043	76052	0 %	60 %	20 %	20 %	209693696
1622	NC_011312	CAAC	2	8	76068	76075	50 %	0 %	0 %	50 %	209693696
1623	NC_011312	TC	3	6	76100	76105	0 %	50 %	0 %	50 %	209693696
1624	NC_011312	AAC	2	6	76135	76140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693696
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1629	NC_011312	GCTC	2	8	76286	76293	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1630	NC_011312	CCAT	2	8	76334	76341	25 %	25 %	0 %	50 %	209693697
1631	NC_011312	TTC	2	6	76345	76350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693697
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1894	NC_011312	GTT	2	6	88956	88961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1902	NC_011312	GTAC	2	8	89500	89507	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1903	NC_011312	GGA	2	6	89704	89709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1998	NC_011312	GGA	2	6	95283	95288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2000	NC_011312	AGTA	2	8	95481	95488	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

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